人偏肺病毒q-pcr檢測方法

人偏肺病毒的q-pcr檢測主要通過(guò)核酸提取、引物探針設計、擴增反應、結果分析和質(zhì)控驗證五個(gè)步驟完成。
采用磁珠法或離心柱法從呼吸道樣本中提取病毒RNA,樣本類(lèi)型包括鼻咽拭子、肺泡灌洗液等。提取過(guò)程需在生物安全柜內操作,防止氣溶膠污染,同時(shí)加入內參基因監控提取效率。提取后的RNA需立即逆轉錄或保存于零下80度環(huán)境。
針對病毒N基因或L基因保守區域設計特異性引物和TaqMan探針。引物長(cháng)度通常為18-22個(gè)堿基,Tm值控制在58-60度,探針5'端標記FAM熒光基團,3'端淬滅基團多選用BHQ1。需通過(guò)BLAST驗證序列特異性,避免與其他呼吸道病毒交叉反應。
采用一步法RT-qPCR體系,包含逆轉錄酶、DNA聚合酶、dNTPs和緩沖液。反應程序設置為50度逆轉錄15分鐘,95度預變性3分鐘后,進(jìn)行45個(gè)循環(huán)的95度15秒、60度1分鐘兩步擴增。每批檢測需設置陽(yáng)性對照、陰性對照和空白對照。
根據擴增曲線(xiàn)Ct值判定結果,通常Ct值≤37為陽(yáng)性,37-40需重復檢測,>40為陰性。采用標準品制作標準曲線(xiàn)進(jìn)行定量分析,擴增效率應保持在90-110%之間。需注意曲線(xiàn)形態(tài)判斷,排除非特異性擴增或抑制現象。
實(shí)驗室需定期參加室間質(zhì)評,每批次檢測需監控內參基因Ct值穩定性。提取環(huán)節加入過(guò)程控制品,擴增體系加入內標檢測抑制物。陽(yáng)性樣本建議進(jìn)行基因測序驗證,新引物探針需通過(guò)靈敏度與特異性驗證,檢測下限需達到100拷貝/毫升。
檢測前24小時(shí)避免劇烈運動(dòng)及高脂飲食,采樣時(shí)使用無(wú)菌聚酯纖維拭子深入鼻咽部旋轉停留10秒,采樣后2小時(shí)內送檢。實(shí)驗室應分區操作避免污染,定期校準熒光定量PCR儀,操作人員需穿戴防護裝備。冬季流行季節可增加檢測頻次,免疫功能低下者出現陰性結果時(shí)建議復測或聯(lián)合血清學(xué)檢查。
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