舒肝和胃丸與舒肝健胃丸的主要區別在于藥物成分與適應癥側重不同，舒肝和胃丸主要用于肝胃不和引起的胃痛脹滿(mǎn)，舒肝健胃丸則側重疏肝理氣、健脾消食。

舒肝和胃丸含柴胡、香附、白芍等成分，側重調和肝胃；舒肝健胃丸含厚樸、枳殼、焦山楂等，偏重健胃消食。

舒肝和胃丸主治肝氣犯胃導致的脘脅脹痛；舒肝健胃丸更適合肝郁脾虛伴食欲不振、噯氣酸腐。

舒肝和胃丸適用于慢性胃炎伴情緒因素；舒肝健胃丸多用于功能性消化不良。

舒肝和胃丸孕婦慎用；舒肝健胃丸含消導成分，脾胃虛寒者需謹慎。

兩者均需中醫辨證使用，避免自行服藥，服藥期間忌辛辣油膩，保持情緒舒暢有助于療效。