肛瘺的治療，分為非手術(shù)治療和手術(shù)治療。藥物治療主要控制感染，減輕癥狀，控制發(fā)展，但不能徹底治愈，或一時(shí)相對治愈，很容易復發(fā)。治療肛瘺唯一有效方法是手術(shù)療法，手術(shù)的治療目的是清除感染的肛門(mén)腺，將瘺管內感染的異物清除，這是治療的關(guān)鍵。

一、非手術(shù)治療：

1.藥物治療：用于治療肛瘺的急性炎癥，由于致病菌多為大腸桿菌、變形桿菌，常使用對革蘭氏陰性桿菌的抗生素或廣譜抗生素，如磺胺類(lèi)藥物、四環(huán)素、慶大霉素、卡那霉素等。

2.外洗藥物：高錳酸鉀坐浴，或用中藥祛毒湯熏洗。

3.外用軟膏：急性炎癥期，可遵醫囑使用莫匹羅星軟膏、夫西地酸鈉軟膏、復方多黏菌素B軟膏等藥物消炎。

二、手術(shù)治療：

1.切開(kāi)法：取側臥位或截石位，局部消毒，局麻或骶麻，用探針尋找內口，將管道病變探查清楚，將主管及支管一一切開(kāi)，搔刮腐爛組織，結扎內口，創(chuàng )面修整平順后凡士林油紗條、紗布、膠布固定，每日用溫水坐浴。瘺管切開(kāi)術(shù)對低位肛瘺而言，因瘺管僅侵犯外括約肌淺層和皮下層，故破壞性小，引流通暢，痊愈后瘢痕組織較小，手術(shù)技巧簡(jiǎn)單，根治率較高。對高位肛瘺而言，由于術(shù)者往往擔心創(chuàng )面引流，故大部分切口較大，大多數都需要切斷外括約肌深層肌纖維，所以術(shù)后有很大一部分病人有不同程度的大便和氣體失禁，顯然這種療法不適用于深部的高位肛瘺。

2.切開(kāi)縫合法：術(shù)前常規準備，側臥位，麻醉后，確定內口位置，從外口插入探針經(jīng)內口穿出，將探針用于勾出肛門(mén)外，再沿探針將管道從外口切至內口，切開(kāi)整個(gè)管道，結扎內口兩側感染的肛隱窩，并將管道全部切除。注意切除所有支管，縫合前注意止血，沖洗傷口然后分層縫合，切口近端要開(kāi)放，便于引流。

3.瘺管切除法：側臥位，常規消毒，麻醉后，判明內口位置，用美蘭再次證實(shí)內口部位，以粗探針從外口插入，從內口穿出，于瘺管兩側的皮膚上做切口。將探針彎曲為環(huán)，左手握住環(huán)形探針兩端用力向外牽拉，將整個(gè)瘺管提起，沿切口繼續切入，切面斜向下至瘺管的深層處，兩側切口會(huì )合將管道從內口到外口作整塊切除，創(chuàng )面修整呈V形，壓迫止血。本療法的優(yōu)點(diǎn)是一次將病變組織切除，引流通暢，缺點(diǎn)是破壞性大，傷面大，愈合時(shí)間長(cháng)，且瘢痕大，常導致肛門(mén)的畸形。僅適用淺表肛瘺。

三、中醫治療：

本病的治療，當注意攻、補的適宜，治實(shí)不忘補虛，補虛則當顧其實(shí)。根據本病的特點(diǎn)，應注重內外兼治、整體與局部并重，初起寒熱交作，大便墜痛，宜用輕劑解散。已成內熱，口干，大便秘結，脈沉實(shí)而有力者，當下之。肛門(mén)腫痛，常欲便而下墜作痛者，導濕熱兼瀉邪火。肛門(mén)腫、疼痛，小便澀滯，小腹急脹者，清肝利小水。出膿腥臭，疼痛不減，身熱者，養血、健脾、更兼滲濕。脾胃虛弱，不能收斂者，滋腎氣、補脾胃。