肛瘺長期不治療可能導致局部感染擴散、肛門功能受損、全身性感染甚至癌變，常見后果包括肛周膿腫反復發(fā)作、肛門失禁、敗血癥及肛管直腸癌。

瘺管周圍炎癥持續(xù)存在可能引發(fā)肛周蜂窩織炎或盆腔感染，表現(xiàn)為紅腫熱痛加劇，需手術切開引流聯(lián)合頭孢曲松、甲硝唑等抗生素治療。

長期炎癥侵蝕肛門括約肌可導致控便能力下降，伴隨排便次數(shù)增多，需通過肛門成形術修復，術后使用乳果糖軟化糞便。

細菌經(jīng)瘺管入血可能誘發(fā)寒戰(zhàn)高熱等全身感染癥狀，需靜脈注射哌拉西林他唑巴坦，并監(jiān)測血培養(yǎng)結果調整用藥。

10年以上慢性炎癥刺激可能惡變?yōu)楦毓芟侔憩F(xiàn)為瘺口硬結潰瘍，確診需病理活檢，治療采用放化療聯(lián)合腹會陰聯(lián)合切除術。

肛瘺患者應保持會陰清潔干燥，避免久坐壓迫，出現(xiàn)發(fā)熱或排便異常時須立即就醫(yī)，慢性瘺管建議每半年進行肛門指檢和腸鏡監(jiān)測。